煩惱之為害甚大，自有根本煩惱，發生枝末煩惱，本末重重，頭數無量。世人多將「煩惱」二字錯解了，以遇逆境，心不愉快，叫做煩惱。不知「煩惱」二字，乃粗細迷惑心之總名。如貪心、瞋心、癡心、疑心、慢心、邪見心，是六種根本煩惱，能生一切枝葉煩惱。如懈怠心、放逸心、昏沉心、散亂心、無慚心、無愧心、諂曲心、嫉妒心等，皆是枝末煩惱，共有八萬四千之多。以是昏煩之法，而能惱亂眾生真性，故名為「煩惱」。
煩惱是苦因，生死為苦果。苦因不斷，苦果決不能離。一切眾生，皆依煩惱惑，而造種種業。由此惑業為因，定招生死果報。所以發心修行，就是要斷煩惱，而了生死。煩惱是眾生內心之病。或外身有病，可請中西醫士，用各種藥品療治，而得痊癒。唯此煩惱心病，中西醫士，皆束手無策；一切藥品，皆不生效力。只有我佛醫王，所說念佛法藥，能治煩惱心病也。
煩惱雖多，總分不出二種：一為我執煩惱，二為法執煩惱。三界之內，六道眾生，二執煩惱全具。
何謂我執煩惱？即一切眾生，都執此身，以為實我。不知諸法本來無我，這個身心，乃是五陰積聚所成，安有實我可得耶？
先就外身研究無我。外身屬色陰，是地、水、火、風四大色法，和合而有。皮肉筋骨，歸地大。痰淚精血，歸水大。周身暖熱，歸火大。鼻息出入，一切動轉，歸風大。四大歷歷可指，外身除卻四大，何者是我？
次就內心研究無我。內心屬受、想、行、識四陰。四陰，不出八個識。前五識，領受五塵外境，是受陰。第六識，想像法塵內境，是想陰。第七識，念念遷流，是行陰。第八識，執持壽命，是識陰。八識界限分明，內心捨此八識，何者是我？
此中四陰之解，乃指八識，而與諸家不同。諸家以受、想、行三陰，指遍行五心所中，受、想、思三心所；識陰總指八個識。余意心法共有八識心王、五十一心所，何以獨取三心所，而配三陰？故不循舊解。今乃以受陰指前五識，因其受力偏強故。想陰指第六識，因其想力最勝故。行陰指第七識，因其恒審思量故。識陰獨指第八識，因其執持壽命故。四陰分指八個識，可包心王、心所一切心法在內。受、想、思三心所，亦復不遺。
今於現在身心之中，仔細推求，皆無有我。又復推求過去，而當父母未生以前，若是有我，我在何處？又復推求未來，眼光落地，命終之後，若是有我，我作何相？過、現、未來，三際求我，無我可得。眾生不了無我之理，迷執身心，以為實我，是為我執煩惱，能障我空真理，此屬內心第一種大病。
何謂法執煩惱？即一切眾生，都執世間所有諸法，以為實法。不知諸法本來不實，如空中華，如夢中境，無體可得。須知空本無華，病眼妄見；夢中之境，睡者妄現，何嘗是真實？世間所有諸法，亦復如是。《金剛經》云：「凡所有相，皆是虛妄。」眾生迷執諸相，以為實法，是為法執煩惱，能障法空真理，此屬內心第二種大病。
眾生所執我、法二種煩惱，都由虛妄想念，分別而生。若無方便對治之法，則二執畢竟無由斷除。故我釋迦如來，觀機施教，說此念佛法門，教人稱念彌陀名號，以一念而除眾念。妄念既除，煩惱自斷。一句佛號，如金剛王寶劍。煩惱妄念，喻如劫賊。賊若來時，寶劍即舉，賊當自退。念佛之法，亦復如是。貪心煩惱起時，即一心念佛，而貪心自息。瞋心、癡心等起時，悉皆如是。專念彌陀，一心不亂，則一切煩惱，自可斷除盡淨矣。
世人多有不信念佛法門，都說稱念一句佛名，有何用處？不知一句彌陀名號，具有不可思議神力，能治一切煩惱心病。如阿伽陀藥，能醫眾病。世間之藥，尚有殊勝功用，以一藥能愈眾病。何況萬德佛名，念之豈不成益？
余每當逆境之來，心生煩惱，遂即經行念佛。四步一聲佛號，四步一聲佛號，循環往復。念之數匝，漸覺心地清涼，熱惱自息。又有時事多心擾，更深不能成寐，亦專稱佛號，歷時少頃，即心神安定，便能睡著，無諸夢想。又當寫經之時，一筆一句佛號，一筆一句佛號，精神不散，妄念不起，寫久亦不覺辛苦。故每教弟子寫經念佛，依教而行者，頗不乏人。因此而念佛進步，能得真實受用，少起煩惱，由是均信念佛，是有莫大之功效。人人果能信此念佛一法，專心稱念，無有間斷，念到心空境寂，煩惱自然無自而生。
或曰：念佛求生西方，貪求極樂世界之樂，此是貪心用事。貪是根本煩惱中第一種煩惱，貪心不除，何得謂為念佛能斷煩惱耶？
答曰：貪之名雖同，而貪之實不同。世人貪著世間塵勞之樂，樂必招苦，此貪即是生死本。今念佛貪求淨土極樂之樂，樂能離苦，此貪乃為解脫法。我佛教人念佛，正是透機之教。觀見眾生，貪戀世間色、聲、香、味、觸五塵之境，念念不捨，以苦為樂。故教人念念念佛，求出娑婆，求生淨土，而得享受極樂之樂，乃為真樂。
佛以念佛求生淨土，離苦得樂，投合眾生厭苦貪樂之心理，乃是以貪止貪之方法。以貪求極樂之一貪，而除貪求塵勞之諸貪。若無此貪，則諸貪無由頓除。譬如止靜之聲，若無此聲，不能遏止諸聲。例如眾人之中，喧嘩混雜。一人高聲喊云：「大家不要說話！」其聲一出，眾聲自止。今貪求極樂之貪，亦復如是，不獨無損，而且大益。余平日，或見清淨園林樓閣，心生愛慕，即轉念西方，行樹羅網，七寶樓閣，勝妙多矣，不必貪此，趕快一心念佛，求生彼國。或聞可愛之聲，即念西方，寶樹羅網出微妙音，譬如百千種樂，同時俱作。或嗅諸香，即念西方，寶蓮行樹，香風時來，六時無間。或見美食好衣，即念西方，思衣得衣，思食得食，自然美妙。故對色、聲、香、味、觸五塵諸境，因羡慕西方極樂勝境，而貪心漸息。
今細將娑婆世界研究一番，具足眾苦，實屬可厭，無一可貪。即以修行論之，娑婆難修，極樂易進。以兩土苦樂對比，乃略舉十種：一者，此土有不常值佛苦，彼土則花開見佛，常得親近之樂。二者，此土有難聞佛法苦，彼土有水鳥樹林皆宣妙法之樂。三者，此土有惡友牽纏苦，彼土有諸上善人俱會一處之樂。四者，此土有群魔惱亂苦，彼土有諸佛護念，遠離魔事之樂。五者，此土有輪迴不息苦，彼土有橫截生死，永脫輪迴之樂。六者，此土有難免三途苦，彼土有永離惡道，名且不聞之樂。七者，此土有世緣障道苦，彼土有受用自然，不俟經營之樂。八者，此土有壽命短促苦，彼土有壽與佛同，更無限量之樂。九者，此土有修行退失苦，彼土有入正定聚，永無退轉之樂。十者，此土有佛道難成苦，彼土有一生補處，速證菩提之樂。
以此而觀，貪求念佛往生，此貪為大貪。即此一貪，可斷貪瞋癡等一切煩惱之心病。但望人人都能貪求往生極樂，則對娑婆五塵欲境，自然不貪。雖同是貪心，實未可以一概論也。余曾有勸修淨土一偈云：「百歲光陰能幾何，勸君及早念彌陀。莫貪五濁娑婆界，極樂蓮邦勝得多。」