無異元來禪師，無明慧經禪師之法嗣，俗姓沙，廬州(今安徽境內)舒城人，生于大明神宗萬歷三年(1575)。元來禪師十六歲遊金陵，一日于瓦棺寺聽講《法華經》，遂生出世之志，于是前往五台山，投靜庵通禪師座下出家。靜庵通禪師傳授給他天台三觀之旨，並囑咐他好好修習。元來禪師于是謹遵師教，精勤修習止觀法門，達五年之久。後前往超華山，從極庵洪禪師比丘戒。
當時，無明慧經禪師正在峨嵋山，大唱曹洞法門，學者奔湊。元來禪師聽說之後，遂前往禮謁。剛到峨嵋，適逢慧經禪師正要下地勞作，荷鋤戴笠，狀如農夫，元來禪師對他的修為頗為懷疑，當即便離開了峨嵋山，來到福建光澤縣的白雲峰，卓庵隱修三年。在這期間，元來禪師寫成《心經指南》，讓人捎給慧經禪師。慧經禪師閱後，寫信告訴他說，所著“非其第一義”。元來禪師羞愧萬分，于是將其手稿付之一炬，然後向慧經禪師所在的方向，焚香遙拜，決心從此以後放棄文字知解，潛心宗門。于是他又獨自繼續呆在庵中，參究了半年，無有省發。
一日，元來禪師偶然翻閱《傳燈錄》。當他讀到“趙州囑僧曰：‘有佛處不得住，無佛處急走過’”這段文字時，恍然有省。于是元來禪師便重新前往峨嵋，參禮慧經禪師。當時慧經禪師已經移住寶方。
于是，元來禪師又趕到寶方。在寶方，元來禪師住了兩個月。為了克期取證，元來禪師用功非常勤苦，雖面目黧黑，憔悴骨立，卻仍然不肯歇息。
一日，慧經禪師應玉山庵之邀請，前往說法，元來禪師奉命同行。一路上，元來禪師談及君臣五位之旨，慧經禪師聽了，不時地稱可。可是快要達到玉山庵的時候，慧經禪師忽然問元來禪師：“佛印大師雲：‘蟻子解尋腥處走，青蠅偏向臭邊飛’，是君位事，臣位事?”
元來禪師道：“臣位事。”
慧經禪師一聽，便呵斥道：“大有人笑汝在!”
元來禪師茫然莫測其旨，心中迷悶不已。
到達玉山庵之後，元來禪師終日獨坐于一小樓中，朝夕提撕，目不交睫。這樣過了一年多。
一日，元來禪師上廁所，準備方便，碰巧看見有一個人正蹲在木板上。他當即豁然大悟，身心踴躍，喜不自勝，如千斤重擔突然落地。
于是，他一路奔跑，往見慧經禪師。慧經禪師的居處，離寶方寺雖有五十裡之遙，可是元來禪師卻感覺到須臾即至。
剛進丈室，元來禪師便展禮大拜。
慧經禪師問道：“子近日如何?”
元來禪師道：“有個活路不許人知。”
慧經禪師道：“因甚不許人知?”
元來禪師道：“不知!不知!”
慧經禪師一聽，非常高興。于是令他充當首座和尚，並贈以付法偈。
當時，元來禪師才二十七歲。
元來禪師得法後不久，便前往鵝湖，從養庵廣心禪師受菩薩戒律，後出世于博山能仁寺，大弘禪化，望風歸學者數以千計。
元來禪師圓寂于崇禎三年(1630)，春秋五十六歲。生前著有《宗教通說》、《參禪警語》等行世。
元來禪師的《參禪警語》，言簡意賅，言無虛發，對如何參禪、做功夫，作了簡明而中肯的開示，堪稱學道者“參禪指南”。現摘其大要如次，供讀者參考——
O學者先發破生死之心，要觀破世界身心，皆為假緣無實。O要疑生從何來，死向何去。O死之一字貼在額上，如一身全死去。O不得耽著靜境。O不得循人情。O全身一個疑團，不見天，不見地，不見山，不見水，一切可亡。O工夫不怕不得活，怕不得死，要疑情成一團而大死著。O舉起話頭時，如貓之捕鼠，無一毫別念。O不可在古人公案上卜度，妄加解釋。O自心是佛名正信，心外取法名邪信，究明自心，親履實踐，至不疑之地。O若真話頭現前時，履冰不寒，蹈火不熱，不為境轉，打成一片也。O尋文逐句，記言記語，害工夫，工夫要心行處絕。O工夫怕比量，將心湊泊，與道相遠。O工夫在切之一字。O用心真切，則不思善，不思惡，無昏沉，不掉舉。O思維莫作詩偈文賦，與參禪相迷。O工夫忌落空。O勿將心待語，時節因緣必大悟。O無可用心處，到萬仞懸崖之處，有轉身之分。O工夫不得有伶俐心，如盲如聾，如撞著銀山鐵壁。O工夫要知非，知非是出死之要路。O工夫雖得輕安，或有省發，不可以為悟。O不可作道理之會，不可作無事之會，不可作擊石火閃電光之會。O遏捺妄心不起，莫守澄湛之地。O莫以觀一切法空為禪。O莫認無形無相之一物。O莫認自己一靈之真性為眼見耳聞。O莫以苦行為解脫。O莫以燒身燃臂禮佛求懺為功課。O莫散淡去、活潑去，逢人則歌舞歡樂，吟詠笑談，或橫行街市，以為了事。O見與法身之理相應，見盡大地光皎皎地，不可坐住著。O與法身之理相應，莫休歇去、沉寂去。O與法身之理相應，莫認眼前隱隱有一物。O與法身之理相應，見光，見華，見種種異相，莫作聖解。O與法身之理相應，四大輕安，正偏道交，莫以作究竟。