上面一段已經談到了機率性的因果關係，但仍局限於古典統計物理的範圍，其根本來源應該是我們所考慮的系統無法作到真正隔離系統；而且觀察所需的時間不能是無窮小，在這時段內，我們只能觀察到某物理量的平均值。因此，嚴格說來，因果關係雖然是機率性的，但因與果間的物理性質仍是決定性的。
現在讓我們談談量子物理（非古典物理）的機率性因果律。這種因果關係，根本上就是機率性的（Probablistic），表示因果間的物理性質具有機率性的特徵。舉例來說，我們掉落一顆石頭，是決定性的因果關係，已如前述。但如果所掉落的，不是石頭，而是質量很小的電子，那麼這種屬於「微觀」世界的物理量，會出現「波」的性質，於是就有「測不準原理」等現象發生；它的掉落路線不能確定，更不用說它落到地面的位置了。這時，因果律本質上就是機率性的。這與前述統計式的機率性，在觀念上完全不同。因此，嚴格講，物理現象的因果關係，是受著波動式和統計式雙重機率性的管制。（詳參作者的《物理與佛學》，慧炬文庫五○一六）。
這裏面有一個明顯的問題存在。石頭只是比電子重若干倍，何以有這麼大的差別？其實，石頭也是有波的性質，只是我們不容易察覺而已。因此，最正確的因果律，應是微觀性的機率性的因果關係。只是在簡單的情形下，或者說機率很大（趨近於1）的情形下， 因果律變成是決定性的因果關係。這裏我想引述一個著名而有趣的例子：愛因斯坦早年曾經不贊同量子理論，他曾帶著嘲弄的語氣，問與他辯論的人們，是否真正相信神靈的權威，是否會求助於擲骰遊戲。這表示他不相信機率論，擲骰子是求機率的方法之一。但是到了現在，量子理論幾乎已經完全被接受了，機率性的因果關係也已然是充分確定了。