清代對佛教文獻的整理，當以完成滿洲文大藏經及龍藏出版為其特色。
一、清朝對漢譯藏經，極為重視。遠在太宗時(一五九五—一六三三)，由達海完成滿洲字的製造，即以滿洲語釋漢譯經典，並從事大乘經典翻譯。降至世祖雍正初年，京城掌管呼圖克圖，奉勅翻譯滿、蒙、藏三體之甘珠爾部。前後經數十年的時間，迨至乾隆二十七年，方始譯竣。供奉於天下佛寺，今聞其版猶在。雍正於禪宗體悟最深，自號圓明居士，實為一禪家帝王。並選唐宋以來，祖師語錄精華，編成「御選語錄」十九卷，以示天下禪林，其於禪林日後啟示很大。
二、乾隆四年(一七二五)，完成七百二十四函，即所謂「龍藏」，或曰「清藏」，頒發諸大寺院。先於康熙年間，編集圓覺、金剛、楞嚴、維摩、仁王、法華、楞伽、深密、涅槃、心地觀經諸部及般若等四函二十二種，內府出版。至雍正時特開藏經館，編刊藏經，迨至乾隆三年完成，歷經五十
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五年，稱為「龍藏」或日「清藏」，共七八三八卷。高宗更以漢譯大藏經及西藏系大藏經為底本，完成滿洲語大藏經，使佛教成為漢、滿、蒙、藏四大民族文化的重心。衛藏通志卷首云：
「御製清文翻譯大藏經序曰：『若夫訂四庫全書，及以國語譯漢全藏經之事，胥舉於癸己(乾隆三八)六旬之後，既而悔，恐難觀其成，然十餘載，而全事成。茲以六旬後所創之典，逮八旬而得觀國語大藏之全成，非昊乾嘉庇其孰能與斯焉，而予之所以增惕欽承者，更不知其當何如矣。』」
乾隆以後，佛教已衰微不堪，忽遇洪秀全之患難，以耶穌為號召，自稱為上帝第二子，對於一切異教都加排斥，無論佛寺、道觀，及民間祠廟，軍行所至，均加燬滅，所謂無廟不焚，無像不燬，佛教文物經典之損失，無異三武一宗之法難。
三、宣統元年，上海殷商羅迦陵女士，篤信三寶，法名大綸，購得日本弘教書院小字藏經，翻印流通，經四年方成，名曰「頻伽藏」，咸稱便利，共八千四百十六卷，每部分裝四十函，由金山宗仰上人主其事。緇素三十餘人，晨抄瞑寫，其功德實不可滅。此為龍藏以後，第一部印版藏經，其有助於研究佛學者之參考，携帶方便。唯未能採取原版校勘，內多錯字，此為美中不足者。並請國學大師章太炎先生為之序。曰：
「大藏經八千餘卷，譯人始漢終元;而東方古德著述附焉。諸經本以般若發端，今從晚明旭大師所定，自華嚴始，則日本弘教書院印本也。故書文字參錯，主以麗藏，記其異同，校讎之功備矣。金山宗仰上人，向以禪宗蟄居退閒，愍今之沙門喜離文字而談實相，末流猥雜，不自墮於亞羊，則愍意
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為矯亂論。弟子頻伽舍主，承其師意，發奮庀工重摹，是本經始弗極，彈指而成，雖處末法之中，而群情歸慕如此，知正信之未衰也。
夫牟尼出世，人天之師，次有馬鳴、龍樹、無著三大士，窮幽體玄，發揚勝義，蕩蕩乎固無得稱焉。教戒不可以發智故，開玄學以導迷;玄學不可以見心故，依靜慮以求證;靜慮不可以接物故，廣萬法以應機。或乃次之，宗教云與基督天方同班，高者亦云徒為倫理，斯所謂以牛蹄測大海也。夫佛陀者，譯言覺;般若者，譯言智;瑜珈者，譯言相應，本所以趨道者，為斷爾炎而證真如，豈真蹩躠以為仁義哉。徒以大悲觀佛，斯以淺矣。所證者無境界可言，見身者無自依之性，故云心佛眾生三無差別，亦云佛當在心中說法，明此方老聃之言，則衣養萬物而不為主。夫何有宗教之封執者乎?明其無主，故小乘大乘，就為佛說，可以無諍也。明其求證，故六趣升沉之談，苦樂酬業之事，可以勿語也。余向以三性三無性，決擇東西玄學，諸有疑滯砉然理解。若夫末世緇衣之林，窮大央居多遠致，而逮近義，斯由不習五明，疏於文史，其過猶小小耳。觀今居長者之流，始隨陸王，終委蛇，以趣佛乘，或有比合景教而言博愛大同之趣，不然則傳合眩人幻術。稱以靈智最下者。惟言酬報情希福田語，皆非量意，惟大迷此。蓋米齊僧佛之所標落，王輔嗣何平叔之所不言，況三乘諸大論師乎?大懼正法之衰，不在謗佛，而在昌言宗教，轉相隱蔽，障或愈深，則圓音或幾乎息矣。往者經論不宣，學者以寡聞為懼，縮印已成，流通始廣，然則密意了義，佛不自言依義依文，定於比量，閱薰之士，其超然自悟於斯。佛湼槃後二千三百八十七年，震旦白衣章炳麟序。」(註一)
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章氏與宗仰上人本屬蘇報患難同志，章氏對於佛學慧解精微，於此益見;其於佛學著作多篇，尤具啟發性。戊戌政變後，國人欲以廟產興辦學校;章氏首作「告佛子書」，促僧徒自覺圖強，自興學校，培育僧材。其於倡導研究佛法，啟發當時巨公名流學者很大，章氏之功德，殊不可忽也!
