綠茶中的兒茶素還可以殺菌。製作組以日本的各種引發食物中毒的細菌為對像進行了實驗。在有細菌的培養液裡，放入綠茶後，大部分細菌都消失了。雖然放置的時間和培養液的濃度有所差異，但是可以觀察到綠茶對引發食物中毒菌的殺菌效果。
成為食物中毒最大原因的沙門氏菌的細胞膜溶解了，大腸菌穿透細胞造成腸道出血。喝一升左右的普通綠茶，在三四個小時內就可以殺死一萬多個細菌。事實上位於日本茶葉栽培區的金澤小學，自從在集體就餐時提供綠茶後，食物中毒的事件明顯減少了。
還有報道說綠茶可以減少口腔內細菌，防止口中產生異味，還能預防蛀牙。