為了確認有無潰瘍及掌握其特性，醫生會讓患者進行鋇餐檢查。服用硫酸鋇造影劑後，造影劑將會積存在有潰瘍的部位，在X光下可以看到該處形成陰影，由此可判斷潰瘍的位置、形狀、大小、深度等。此外，根據潰瘍周圍的隆起方式等，也可判斷潰瘍的惡化程度。
胃鏡檢查也很常見。胃鏡前端有幾個小洞，洞裡放入攝像機，可拍攝潰瘍部位的彩色照片，或直接在電視畫面上觀看。這項檢查可以逼真地觀察潰瘍的形狀和特性，因此要確定潰瘍是否需要治療時，一般都會進行內窺鏡檢查。
另外，胃鏡檢查還可以根據潰瘍的形狀或周圍的狀況來鑒別是潰瘍還是癌。如果肉眼不容易判斷，則可以在胃鏡管裡放入附有刀子的器具，採集組織，然後用顯微鏡觀察採集來的組織，這叫做活組織檢查。通過這項檢查，可明確判斷組織是否癌變。
懷疑病變擴及胃壁深處時，可能要進行超聲波胃鏡檢查。胃鏡前端發射超聲波，再送入接收反射波的設備，然後以影像的形式明確掌握胃壁內部的結構。
在進行藥物療法前，為了調查使用何種藥物較合適，有時醫生還會進行胃液檢查。胃液檢查的方法是，從口中放入纖細的橡皮管至胃內，然後採集胃液進行化驗。
潰瘍的治療需要從多方面著手
消化性潰瘍的治療方法有內科療法（藥物治療為主）和外科療法（切除潰瘍部位）兩種。如果沒有穿孔、大出血、幽門梗阻等併發症，採用內科療法就足夠了。使
用內科療法治癒的時間，因潰瘍的程度而異，也有個體差異，不過，大致上治癒胃潰瘍約需要3個月、十二指腸潰瘍約需要2個月。
藥物療法
一般採取抑制攻擊因子的藥物和加強防禦因子的藥物搭配服用的方法。抑制攻擊因子的藥物有胃酸分泌抑制劑、抗酸劑、抗胃蛋白酶劑、抗膽鹼劑、抗胃泌素劑等。加強防禦因子的藥物有黏膜保護劑，黏液分泌促進劑、前列腺素制劑等。
而這些藥物當中，胃酸分泌抑制劑中的H2受體阻斷劑更是被稱為治療消化性潰瘍的特效藥。自從這幾種藥開始被使用以後，消化性潰瘍的治癒率得到大幅度提高。
由於消化性潰瘍復發的病例並不少見，因此有時需要在治癒後的一定時期內持續服藥，這叫做維持療法。就H2受體阻斷劑而言，當潰瘍逐漸痊癒時，藥物服用量也逐漸減少。一般是在一定時期內，持續服用原來一半量的H2受體阻斷劑和黏膜保護劑。
不過，由於藥效因人而異，因此關於應服藥時間，應向醫生咨詢後再做決定。
質子泵抑制劑是一種抑制胃酸分泌的藥物，其作用比H2受體阻斷劑還要強烈，如果長期過度服用，會產生較強的副作用。因為當胃酸分泌減少時，除了胃裡面的酸度會下降、殺菌作用會衰退之外，消化蛋白質的酶也會難以發揮作用。其適用時間為胃潰瘍8周、十二指腸潰瘍6周。
中藥預防潰瘍復發雖然H2受體阻斷劑和質子泵抑制劑等特效藥的出現，促使消化性潰瘍的治療效果大幅提升，但是還尚未達到抑制潰瘍復發的地步。為此，有時
可用中藥來防止復發。潰瘍通常按照活動期→治癒期→瘢痕期的順序逐漸痊癒，若在治癒期和瘢痕期採取中藥和H2受體阻斷劑並用的方法，會有顯著效果。最常用
的中藥有柴胡桂枝湯、六君子湯、四逆散等。這三味中藥的共通之處是，都含有甘草這種生藥。甘草已被證實具有抗潰瘍的作用，現在也多被製成西藥。而柴胡桂枝
湯和四逆散中含有的柴胡具有鎮靜、抑制胃液分泌的作用。除此之外，多種生藥都含有幫助治療潰瘍的作用，這點也已獲得西醫的實驗證明。