釋慧日、俗姓辛氏，東萊人，唐中宗的時候得度出家，隨即登壇受具足戒。後來遇到義淨三藏，因而通達了一乘究竟之法，對於義淨三藏能夠親自前往拜詣天竺佛國，心中一直有羨慕之意，有一日便立下誓願要遊於西域。開始前往天竺時是坐船舶渡海，如是經過了三年，中國東南海中的諸國如崑崙、佛誓、師子洲等國家，差不多都經歷過。後來才到達天竺，隨即一一參禮釋迦世尊聖跡所在之地，探尋求訪梵文的經典，並參訪善知識，如是經過一十三年，咨問稟受佛法之訓示。後來心中想要利益眾生，於是振錫回到東土故鄉，以獨自一人之身影長途遠征，陸行經過雪嶺及西域胡人之家鄉，如是又經歷了四年。
慧日法師既經過如是種種的艱難痛苦，因此深深厭離南閻浮提。心中不知有國土、有何方所，只有安樂而無有痛苦？又有何法門、有何修行，能夠快速得以見佛？於周遍地參問了天竺國的三藏學者，而其所說的皆是讚歎極樂淨土，並且合乎於釋迦牟尼佛金口所說之法。念佛法門是極為快速之法門，是一生便可得生淨土之路，盡此一生之報身，必定得以往生極樂世界，親得奉事阿彌陀佛。慧日法師聽聞之後頂戴受持。
然後慧日法師又漸漸來到北印度，有一健馱羅國，其王城的東北方，有一座大山，山上有觀世音菩薩聖像，凡有一心志誠而恭敬祈禱請求者，菩薩大多會現身。慧日法師於是七日至誠頂禮叩頭，並且斷食，以畢其性命見到菩薩為期。到了第七日夜裡尚未半夜之時，觀世音菩薩在空中現出紫金色之相貌，身長有一丈多，坐在寶蓮華之中，垂下右手撫摩慧日之頭頂曰：「你想要弘傳佛法以自利利他，在此西方有淨土，名曰極樂世界，阿彌陀佛如今現在彼國，應當勸令眾生念佛誦經，迴向發願往生西方。到彼極樂國土之後，即得親見阿彌陀佛及我觀世音菩薩，可以得到廣大之利益。你自己應當知道，淨土法門勝過於其他種種之修行。」說完之後觀世音菩薩即消失不見。慧日法師原本經過幾日的斷食，身體非常疲困，聽聞到菩薩的開示之後，身體突然強壯起來了。
等到登上蔥嶺向東而歸時，總共已經走過了七十餘個國家，歷時共有一十八年。唐朝開元七年，才到達長安，向皇帝進獻了佛陀真容之畫像以及梵文的經典等等，令皇帝之心意開悟歡喜，因此賜號曰『慈愍三藏』。
慧日三藏平生常常勤修淨土法門之行業，著作《往生淨土集》流傳於當世。其教化之道與善導大師、少康大師，雖然不同時代，但是卻同是以念佛法門教化眾生也。此外又因為僧眾之徒，大多迷昧不知五辛之中『興渠』是什麼，因為關於興渠，人們大多說法不同，有人說是蕓薹胡荽，有人說是阿魏，唯有慧日三藏在其《淨土集》的別行書中說道：「五辛，此土唯有四種，一蒜、二韭、三蔥、四薤，缺於興渠，梵語稍微有些差偽，正確之音為『形具』。我在其它的國家中不曾見到，只有在回國時經過于闐，才得見到此物。其根粗細如細蔓菁，根是白色的，其臭味如同蒜。彼國之人種植此物以取其根部而食。在冬天的時候，到彼田園則不見其枝葉。薹荽非是五辛，所以食之無罪，慧日我親見此事而可以證驗也。」
唐朝天寶七年，命終於所住之佛寺，人們稱其享齡六十九歲，葬於白鹿原，後來成為一個小塔。高僧傳三集聲德篇